De eerste Prototype was geen grafisch hoogstandje en vloog niet met hoge snelheid over de toonbank. Hoe dan ook werkt ontwikkelaar Radical Entertainment aan een vervolg. Volgens de ontwikkelaar zijn de twee miljoen verkochte exemplaren goed genoeg voor een vervolg.

In de developer diary krijgen we meer informatie over de hoofdpersonages in Prototype 2. In de game speel je weer met Alex Mercer, daarnaast is er een ander personage bijgekomen. We hebben het over James Heller, een man die zijn familie is verloren door het virus.

Alex en James zijn totaal geen vrienden en zullen alles eraan doen om elkaar uit te schakelen. Prototype 2 laat voorlopig nog even op zich wachten, de game staat in de planning voor 2012.